公司微生物研究室建立了关于堆肥发酵（高温菌）、养地修复（生防功能菌）、功能复配（复合功能菌）等系统性菌种资源库，其中功能菌100余种，并且利用不同功能菌的功能互补优势，已建立细菌与真菌及防线菌等的复合菌群互补功能体系。研究室以工程技术中心为依托，与中国农业大学、南京农业大学、华中农业大学、中国矿业大学等科研院校进行深入合作，以校-企联合方式进行理论向科研转化及推广方面的交流合作。

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  高温菌：降解纤维素菌、降解蛋白质菌、降解淀粉菌、降解油脂菌。

  已得到有效菌株20多种，已验证功能菌株10多种，利用不同高温菌的不同功能与其他菌种复合，建立起高效环保快速堆肥体系，针对餐厨废弃物、粪渣等提高其堆肥发酵效果与水平。

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  功能菌：生防功能菌、盐渍化修复菌、连作障碍改良菌

  已建立以木霉、放线菌、芽孢杆菌等为主的生防菌株体系，已获得具有生防、盐渍化治理、连作障碍等功能菌株30余种，已验证功能菌株10多种。对土壤连作障碍、土壤盐渍化及植物生防病害具有显著的效果。

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  复合功能菌：土壤修复复合菌、盐渍化修复复合菌、连作障碍促生复合菌、堆肥发酵复合菌。

  利用较为亲和的菌株及功能互补的菌株进行复配，配合以高含量有机质等基质，不仅可在土壤中建立以复合功能菌为代表的优势菌群，还可提高优化土壤结构，提高土壤肥力。